Asosiy farq - Proteomika va Transkriptomika
 

Omik texnologiyasi - bu hozirgi tendentsiya bo'lib, unda organizmning turli xil biomolekulalari uning xususiyatlari va funktsiyalari bo'yicha butun to'plam sifatida ko'rib chiqiladi. Omic texnologiyasi keng qo'llanishga ega. Biologik namunaning turli xil omikasi genomika, proteomika, transkriptomika va metabolomikani o'z ichiga oladi. Proteomika tirik organizmdagi barcha oqsillarni to'liq o'rganishni o'z ichiga oladi. Bu organizmdagi barcha ifodalangan oqsillar to'plami, uning tarkibiy va funktsional xususiyatlari sifatida belgilanadi. Oqsillarning to'liq to'plami, shuning uchun protein hosil qiladi. Transkriptomika - tirik organizmda mavjud bo'lgan barcha messenjer RNK (mRNA) molekulalarini to'liq o'rganish. Shunday qilib, transkriptomika tirik organizmda faol ravishda namoyon bo'ladigan genlar bilan shug'ullanadi. Tirik organizmdagi mRNKlarning jami to'plamiga transkriptoma deyiladi. Proteomika va Transkriptomika o'rtasidagi asosiy farq biomolekula turiga bog'liq. Proteomikada tirik organizmdagi ifoda etilgan oqsillarning umumiy to'plami o'rganiladi, transkriptomiyada esa tirik organizmning mRNK jami o'rganiladi.

MUNDARIJA

1. Umumiy nuqtai nazar va asosiy farq
2. Proteomika nima
3. Transkriptomika nima
4. Proteomika va Transkriptomika o'rtasidagi o'xshashliklar
5. Yonma-yon taqqoslash - Proteomics vs Transcripttomics tabular shaklida
6. Xulosa

Proteomika nima?

Proteomika atamasi 1995 yilda aniqlangan va dastlab hujayra, to'qima yoki organizmdagi oqsillarning to'liq komplekti sifatida aniqlangan. Proteomik tadqiqotlar rivojlanishi bilan, keyinchalik ko'plab o'rganish sohalari kiritilgan soyabon atamasi sifatida ko'rib chiqish uchun o'zgartirildi. Hozirgi vaqtda proteomika mavzusi bo'yicha oqsillarning tuzilishi, yo'nalishi, funktsiyalari, o'zaro ta'siri, modifikatsiyasi, qo'llanilishi va ahamiyati o'rganilmoqda. Shuning uchun hozirgi paytda proteomika sohasida ko'plab tadqiqotlar olib borilmoqda.

Birinchi proteomik tadqiqotlar Escherichia coli-dagi protein tarkibini aniqlash uchun o'tkazildi. Umumiy oqsil tarkibini xaritalash ikki o'lchovli (2D) jel yordamida amalga oshirildi. Muvaffaqiyatga erishgandan so'ng, olimlar Gvineya cho'chqalari va sichqonlar kabi hayvonlarda oqsilning umumiy miqdorini tavsiflashga o'tdilar. Hozirgi vaqtda inson oqsilini xaritalash 2D gel elektroforez yordamida amalga oshiriladi.

Proteomikaning qo'llanilishi

Proteomikani o'rganishning ko'pgina afzalliklari bor, chunki oqsillar proteinlarning katalizator xossasi tufayli faoliyatning ko'p qismini boshqaruvchi molekulalardir. Shunday qilib, butun oqsillarni o'rganish organizmning salomatlik holati to'g'risida ma'lumot berishi mumkin. Ba'zi dasturlar mavjud;

  1. Genomning izohi: Organizmdagi oqsil tarkibini o'rganish orqali faol protein birikmasining aniq genomlarini aniqlash mumkin. Ushbu stsenariyda barcha genomika natijalari, Transkriptomika va proteomika muhim ahamiyatga ega. Kasalliklarni aniqlash / Diagnostika: Proteomika kasallik holatini aniqlashda sog'lom va kasallarni taqqoslashda qo'llaniladi. Tajriba davomida o'rganilgan oqsilni ifoda etish. Proteinlarning modifikatsiyasi va o'zaro ta'sirini o'rganish: In vitro sharoitida yoki in vivo sharoitida oqsillarni ishlatish uchun, bu ajratib olingan oqsillarni saqlash sharoitlarini aniqlash va in vitro, in vivo va in-siliko usullaridagi oqsillarning xatti-harakatlarini o'rganish.

Proteomikada turli xil texnikalar mavjud

  1. Umumiy oqsilni ekstraktsiya qilish va 2D gel elektroforez yordamida oqsillarni ajratish. Proteinlarni, shuningdek, yuqori samarali suyuqlikli xromatografiya (HPLC) yordamida ajratish mumkin. Edmundning sekvestratsiya usuli yoki Mass spektrometriya kabi usullardan foydalanib olingan oqsillarni saralash. Tarkiblar aniqlangandan so'ng, protein tarkibidagi tarkibiy va funktsional xususiyatlar kompyuterga asoslangan dasturiy ta'minot va bioinformatika vositalari yordamida tahlil qilinadi.

Transkriptomika nima?

Transkriptom atamasi yaqinda ishlatilgan. Transkriptomiya bu organizmning mRNK tarkibini o'rganishdir. Umumiy mRNK tirik organizmda yoki hujayrada ifodalangan DNKdir. MRNKning to'liq to'plami transkriptoma deb nomlanadi.

Transkriptomani tahlil qilish bosqichlariga quyidagilar kiradi:

  1. RNKni ekstraktsiya qilish, poli DT boncuklar yordamida ustunli gel xromatografiya yordamida mRNKni ajratish MRNKni navbatga qo'yish amalga oshiriladi.

Microarray texnologiyasi organizm transkriptomasini aniqlashning keng tarqalgan usullaridan biridir. Mikroarray usuli transkriptomaning qo'shimcha iplari bilan zond plastinkasini o'z ichiga oladi. Gibridlashdan so'ng organizmda yoki hujayralarda mavjud bo'lgan mRNKni tavsiflash mumkin.

Transkriptomika hozirda tibbiyot sohasida keng qo'llaniladi. Kasalliklarni tashxislash va kasalliklarni profilaktika qilish Transkriptomiya qo'llaniladigan asosiy sohalardir. Organizmning transkriptomasini tahlil qilish orqali chet el mRNKsi aniqlanishi, agar biron bir infektsiyasi bo'lsa, uni aniqlash mumkin. Kodlanmaydigan RNKni transkriptomik texnologiyalar yordamida ajratish mumkin. Shuningdek, turli xil ekologik stresslar ostida genlarning namoyon bo'lishi kuzatilishi mumkin.

Proteomika va Transkriptomika o'rtasidagi o'xshashliklar qanday?

  • Ikkalasi ham omic texnologiyasi tushunchasining bir qismini tashkil qiladi. Ularning ikkalasi kasallik diagnostikasi va organizmning kasallik belgilarida qo'llaniladi. Ikkala tadqiqot yo'nalishi biomolekulani ajratib olish, biomolekulani ajratish va tartiblash bosqichlarini o'z ichiga oladi.

Proteomiklar va transkriptomiyalar o'rtasidagi farq nima?

Protemiklar va transkriptomika
Proteomika tirik organizmdagi barcha oqsillarni to'liq o'rganishni o'z ichiga oladi.Transkriptomika bu tirik organizmda mavjud bo'lgan barcha messenjer RNK (mRNK) molekulalarini to'liq o'rganishdir.
Bio molekula turini o'rgangan
Proteinlar proteomikada o'rganiladi.mRNK transkriptomikada o'rganiladi.
O'rganilgan omillar
Oqsillarning tuzilishi, funktsiyasi, o'zaro ta'siri, modifikatsiyasi va qo'llanilishi proteomikada o'rganiladi.Transkriptomikada ketma-ketlik tuzilishi, atrof-muhit bilan o'zaro bog'liqlik va mRNK qo'llanilishi o'rganiladi.

Xulosa - Proteomika va Transkriptomika

Omics hayot haqidagi fanlar sohasida muhim rol o'ynaydi. Proteomika - bu hujayradagi yoki organizmdagi oqsillarning to'liq to'plamini tashkil etadigan proteomni o'rganishni anglatadi. Transkriptomika deganda mRNK ko'rinishida ifodalangan DNKning to'liq to'plami bo'lgan transkriptomani o'rganish tushuniladi. Ikki o'rganish yo'nalishi, proteomika va transkriptomika, genomika joriy etilganidan keyin paydo bo'lgan va hozirda tibbiy diagnostika, organizmlarning xarakteristikasi va skriningi sohasida keng qo'llaniladi. Bu proteomika va transkriptomika o'rtasidagi farq.

Proteomics va Transkriptomikaning PDF-ni yuklab oling

Siz ushbu maqolaning PDF-versiyasini yuklab olishingiz va uni oflayn maqsadlarda foydalanishingiz mumkin. Iltimos, PDF formatida yuklab oling: Proteomiklar va Transkriptomiyalar o'rtasidagi farq

Ma'lumot:

1.Horgan, Richard P va Luiza K Kenni. "Omic" texnologiyalari: genomika, transkriptomika, proteomika va metabolomika. "Akusher va ginekolog, Blackwell Publishing Inc, 2011 yil 18 iyul. Bu erda mavjud
2.Graves, Pol R. va Timoti A. Xeysted. "Molekulyar biologning prototeomikaga oid qo'llanmasi." Mikrobiologiya va molekulyar biologiya sharhlari, Amerika Mikrobiologiya Jamiyati, 2002 yil mart.
3.Lowe, Rohan va boshqalar. "Transkriptomika texnologiyalari". PLoS hisoblash biologiyasi, jamoat ilmiy kutubxonasi, 2017 yil may. Bu erda mavjud

Rasmga muloyimlik:

1.Xxl7441-da inglizcha Vikipediya-protokollari - en.wikibooks-dan Commons-ga ko'chirildi. (Public Domain) Commons Wikimedia orqali.
2. Thomas Shafee tomonidan mikrokriptizatsiyalash va tartiblash. O'z ishim (CC BY 4.0) Commons Wikimedia orqali