1D va 2D gel elektroforez o'rtasidagi asosiy farq gel elektroforezida oqsillarni ajratish uchun ishlatiladigan xususiyatlardir. 1D gel elektroforez faqat oqsillarni molekulyar og'irlik asosida ajratadi, 2D gel elektroforez esa oqsillarni uning izo-elektr nuqtasi va molekulyar og'irligiga qarab ajratadi.

Proteinni gel elektroforez bilan ajratish oqsillarni tavsiflashda muhim vositadir. Proteinlar o'zgaruvchan xususiyatlarga ega; shuning uchun agaroz gel elektroforezida DNK ajratish bilan solishtirganda ajratish ancha murakkabroq.

MUNDARIJA

1. Umumiy nuqtai nazar va asosiy farq
2. 1D Gel Elektroforez nima
3. 2D Gel Elektroforez nima
4. 1D va 2D gel elektroforez o'rtasidagi o'xshashliklar
5. Yonma-yon taqqoslash - jadvalli shaklda 1D vs 2D gel elektroforez
6. Xulosa

1D Gel Elektroforez nima?

1D Gel Elektroforez, shuningdek, bir o'lchovli gel elektroforez, molekulyar og'irlik asosida oqsillarni ajratish usuli hisoblanadi. Proteinni ajratish asosan poliakrilamid gel elektroforez yordamida amalga oshiriladi. Jel elektroforez kontseptsiyasiga asoslanib, molekulalar molekulyar og'irlik va zaryad xususiyatlariga ko'ra ajralib chiqadi.

Shuning uchun, oqsillarga bir xil zaryad berish uchun, natriy dodetsil sulfat (SDS) bilan davolash gel elektroforezidan oldin amalga oshiriladi. SDS oqsillarni tanqid qiladi va oqsilga yagona manfiy zaryad beradi; elektr maydonini qo'llash amalga oshirilganda, oqsillar molekulyar og'irliklariga qarab ijobiy terminalga o'tadi. Shunday qilib, ajratishda faqat bitta mulk hisobga olinadi. Shuning uchun bu usul 1D gel elektroforez deb ataladi.

1D gel elektroforez paytida oqsillar molekulyar og'irliklariga qarab ajratiladi. Shu munosabat bilan, quyi vaznli molekulalar yuqori molekulyar og'irlikdagi oqsillarga nisbatan jelda tezroq harakat qiladilar. Shunday qilib, yuqori vaznli oqsillar quduqlarga yaqin joyda qoladi.

2D Gel Elektroforez nima?

2D gel elektroforez yoki ikki o'lchovli gel elektroforez oqsillarni ikki xususiyat asosida ajratadi. Ikki xususiyat oqsil va molekulyar og'irlikning izo-elektr nuqtasidir. Proteinni ajratishning bu usuli oqsil ajratish hajmini oshiradi. Proteinning izo-elektr nuqtasi oqsil neytral bo'lgan pH ga bog'liq.

Shunday qilib, 2D gel elektroforezida protein birinchi o'lchovdagi sobit pH gradientida ishlashiga ruxsat beriladi. Ikkinchi o'lchovda oqsillar vertikal yoki gorizontal poliakrilamid gel elektroforez yordamida ajratiladi. Shunday qilib, oqsillar ikkinchi o'lchamdagi molekulyar og'irliklariga ko'ra ajraladi.

Bundan tashqari, jel elektroforezida bu usul proteinni ajratish qobiliyatini oshiradi. Shuning uchun ajratilgan oqsillar yanada toza bo'ladi. Biroq, texnikaning narxi bir o'lchovli gel elektroforeziga qaraganda ancha yuqori.

1D va 2D gel elektroforez o'rtasidagi o'xshashliklar qanday?

  • Ikkala usul ham oqsillarni ajratib turadi. Shunday qilib, ular oqsillarni tavsiflashda muhim ahamiyatga ega.

1D va 2D gel elektroforez o'rtasidagi farq nima?

1D va 2D gel elektroforez o'rtasidagi asosiy farq shundaki, 1D gel elektroforez oqsillarni faqat molekulyar og'irlik asosida ajratadi, 2D gel elektroforez esa oqsillarni ikkala izo-elektr nuqtasi va molekulyar og'irligiga qarab ajratadi. 1D va 2D gel elektroforez o'rtasidagi ushbu asosiy farq tufayli, oqsillarni ajratish qarori va ikkala texnikaning narxi ham farq qiladi. 2D gel elektroforez 1D gel elektroforeziga qaraganda yuqori piksellar sonini ko'rsatadi. Biroq, 2D gel elektroforez 1D gel elektroforeziga qaraganda ancha qimmatga tushadi.

Quyida infografikada 1D va 2D gel elektroforez o'rtasidagi farqni umumlashtiradi.

Jadval shaklida 1D va 2D gel elektroforez o'rtasidagi farq

Xulosa - 1D vs 2D Gel Elektroforez

Oqsillarni ajratish ko'plab omillarga bog'liq. 1D gel elektroforez oqsillarni faqat molekulyar og'irlik asosida ajratadi. Shu bilan birga, ikki o'lchovli yoki 2D gel elektroforez oqsilni ajratish rezolyusiyasini oshiradi. Bundan tashqari, 2D gel elektroforez oqsillarni izo-elektr nuqtasi va molekulyar og'irligiga qarab ajratadi. Shu sababli, ushbu ma'lumotlar oqsillarni quyida qayta ishlashda va proteomika sohasida muhim ahamiyatga ega. Shunday qilib, bu 1D va 2D gel elektroforez o'rtasidagi farqning xulosasi.

Ma'lumot:

1. Galeva, Nadejda va Mixail Altermann. "Bir o'lchovli va ikki o'lchovli gel elektroforezini taqqoslash: Kalamush jigar mikrosomalarini proteomik tahlil qilish uchun ajratish vositasi: Sitokromlar P450 va boshqa membranali oqsillar." Proteomika, AQSh Milliy tibbiyot kutubxonasi, 2002 yil iyun, shu erda mavjud.

Rasmga muloyimlik:

1. "Elektroforez - 1D gel quduqlarini oqsillar aralashmasi bilan to'ldirish" Jean-Etyenne Poirrier tomonidan - 1D gel quduqlarini oqsillar aralashmasi bilan to'ldirish (CC BY-SA 2.0) Commons Wikimedia orqali
2. Milliy Sog'liqni Saqlash Instituti tomonidan "2D elektroforez" - Saratonni o'rganish bo'yicha Nanobiologiya dasturi, Milliy sog'liqni saqlash instituti (jamoat mulki) Wikimedia Commons orqali